Sondas de hibridación de ácido nucleico ultraespecíficas de ajuste fino.

Una composición para la interacción selectiva con una molécula de ácido nucleico diana,

en donde la molécula de ácido nucleico diana comprende una sexta región y una séptima región, comprendiendo la composición:

una primera concentración de una primera cadena de ácido nucleico que comprende una primera región, una segunda región y una tercera región;

una segunda concentración de una segunda cadena de ácido nucleico que comprende una cuarta región y una quinta región;

en donde la primera y la segunda concentración son tales que una interacción entre la composición y la molécula de ácido nucleico diana posee una energía libre estándar determinada por la Expresión 1 [ΔGo rxn = ΔGo t-TC - ΔGo nh-PC + (ΔGo v-TC - ΔGo h-PC)] que es igual a la energía libre estándar determinada por la Expresión 2 [-RTln(([P]0 - [C]0)/[C]0))], donde el término [P]0 término de la expresión 2 es igual a la segunda concentración y el término [C]0 de la Expresión 2 es igual a la primera concentración, y donde la segunda concentración es mayor que la primera concentración; y en donde la composición posee una energía libre estándar de hibridación con la molécula de ácido nucleico diana de aproximadamente -5 kcal/mol a aproximadamente +5 kcal/mol tal como se determina mediante la Expresión 1; y

en donde el término ΔGo t-TC de la Expresión 1 representa la energía libre estándar de hibridación entre la sexta región y la primera región, en donde el término ΔGo nh-PC de la Expresión 1 representa la energía libre estándar de hibridación entre la quinta región y la tercera región, en donde el término ΔGo v-TC de la Expresión 1 representa la energía libre estándar de hibridación entre la séptima región y la segunda región, en donde el término ΔG °h-PC de la Expresión 1 representa la energía libre estándar de hibridación entre la cuarta región y la segunda región, y en donde los valores para ΔGo t-TC y ΔGo nh-PC difieren en más del 10 %.

Tipo: Patente Internacional (Tratado de Cooperación de Patentes). Resumen de patente/invención. Número de Solicitud: PCT/US2014/052827.

Solicitante: WILLIAM MARSH RICE UNIVERSITY.

Inventor/es: ZHANG,DAVID YU, WANG,JUEXIAO, WU,RUOJIA.

Fecha de Publicación: .

Clasificación Internacional de Patentes:

  • C07H21/04 QUIMICA; METALURGIA.C07 QUIMICA ORGANICA.C07H AZUCARES; SUS DERIVADOS; NUCLEOSIDOS; NUCLEOTIDOS; ACIDOS NUCLEICOS (derivados de ácidos aldónicos o sacáricos C07C, C07D; ácidos aldónicos, ácidos sacáricos C07C 59/105, C07C 59/285; cianohidrinas C07C 255/16; glicales C07D; compuestos de constitución indeterminada C07G; polisacáridos, sus derivados C08B; ADN o ARN concerniente a la ingeniería genética, vectores, p. ej. plásmidos o su aislamiento, preparación o purificación C12N 15/00; industria del azúcar C13). › C07H 21/00 Compuestos que contienen al menos dos unidades mononucleótido que tienen cada una grupos fosfato o polifosfato distintos unidos a los radicales sacárido de los grupos nucleósido, p. ej. ácidos nucleicos. › con desoxirribosilo como radical sacárido.
  • C12Q1/68 C […] › C12 BIOQUIMICA; CERVEZA; BEBIDAS ALCOHOLICAS; VINO; VINAGRE; MICROBIOLOGIA; ENZIMOLOGIA; TECNICAS DE MUTACION O DE GENETICA.C12Q PROCESOS DE MEDIDA, INVESTIGACION O ANALISIS EN LOS QUE INTERVIENEN ENZIMAS, ÁCIDOS NUCLEICOS O MICROORGANISMOS (ensayos inmunológicos G01N 33/53 ); COMPOSICIONES O PAPELES REACTIVOS PARA ESTE FIN; PROCESOS PARA PREPARAR ESTAS COMPOSICIONES; PROCESOS DE CONTROL SENSIBLES A LAS CONDICIONES DEL MEDIO EN LOS PROCESOS MICROBIOLOGICOS O ENZIMOLOGICOS. › C12Q 1/00 Procesos de medida, investigación o análisis en los que intervienen enzimas, ácidos nucleicos o microorganismos (aparatos de medida, investigación o análisis con medios de medida o detección de las condiciones del medio, p. ej. contadores de colonias, C12M 1/34 ); Composiciones para este fin; Procesos para preparar estas composiciones. › en los que intervienen ácidos nucleicos.
  • C40B30/04 C […] › C40 TECNOLOGIA COMBINATORIA.C40B QUIMICA COMBINATORIA; BIBLIOTECAS, p. ej. QUIMIOTECAS (bibliotecas combinatorias in silico de ácidos nucleicos, proteínas o péptidos G16B 35/00; química combinatoria in silico G16C 20/60). › C40B 30/00 Procedimientos de selección de bibliotecas. › midiendo la capacidad para unirse específicamente a una molécula diana, p. ej. unión anticuerpo-antígeno, unión receptor-ligando.

PDF original: ES-2771773_T3.pdf

 

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